實驗介紹

4D-蛋白質組學是基于新一代timsTOF Pro質譜儀，通過捕集離子淌度（TIMS）與同步累積連續碎裂（PASEF）掃描模式進行差異定量蛋白質組學研究。該技術核心是在傳統3D分離（保留時間、質荷比、離子強度）基礎上，增加肽段的碰撞截面積（CCS），實現第4維度（離子淌度）的分離檢測。 4D-DIA蛋白質組學是基于timsTOF Pro離子淌度平臺的新一代DIA技術，通過數據非依賴采集-同步累積連續碎裂（diaPASEF）掃描模式進行差異定量蛋白質組學分析。將DIA技術與基于timsTOF Pro上的diaPASEF技術相結合，具有高掃描速度和高靈敏度優勢的同時，外加第四維離子淌度分離，使DIA數據在采集時不犧牲窗口循環速度的同時，降低譜圖復雜度和提高離子利用率，實現了蛋白質組學在覆蓋深度、靈敏度、通量方面的全面性提升。

實驗流程：

應用方向

? 臨床微量樣本檢測方式，如：外泌體、FFPE石蠟切片、活檢穿刺組織等

? 臨床大隊列樣本分析，如腫瘤、心血管等重大疾病精準分型

? 作物群體性狀等大規模樣本研究，如育種品系、脅迫干預等

? 臨床生物標志物發現：DIA接近MRM的定量能力，實現標志物篩選與初步驗證過程合二為一

? 生物樣本信息庫構建：DIA可實現生物信息的完整保存，為后續回溯分析提供保障。藥物應答、基因敲除/過表達的蛋白表達譜分析

數據分析

技術優勢

? 4D技術加持，更加適合微量樣本

? 克服標記定量蛋白質組學技術在樣本數量上的限制，靈活方便

? 采用布魯克的timsTOF Pro質譜平臺，檢測速度提升近一倍