生物安全實驗室通過防護屏障和管理措施，達到生物安全要求的生物實驗室和動物實驗室。人們對生物安全的研究還剛剛起步，對生物安全的認識也還需要不斷加深，對于有關的措施也還需要逐步地改進，根據以往的實踐和經驗教訓，我生物安全至少應遵從以下原則：
　　
　　一、科學合理的原則
　　
　　傳染性和致病性再強的病原微生物，只要它不和人體接觸，感染就不會發生。
　　
　　1．屏障原理把病原體圍場在一定空間范圍內，使之避免暴露在開放的環境中，操作者間接對其操作（如手套、機械手等），在圍場內接觸的空氣和水體經過處理后排放。在實驗室內使用的生物安全柜，實驗室設施均屬此類。
　　
　　2．過濾原理在圍場（包括安全柜和實驗室）內接觸的空氣均視為污染的有害物質，把實驗室內空氣經過HEPA濾器過濾后或其他凈化后排放，以保護環境。
　　
　　3．消毒滅菌原理實驗室污染區和半污染區的一切物品，包括空氣、水體和所有的表面（儀器）等均被視為污染有危害的。所以都要對其消毒處理，特別是對實驗后的廢液，器材和手套務必嚴格處理。廢液廢物在拿出實驗室之前務必*滅菌。在實驗完成后撤離實驗室過程中每一步要用有效消毒把好關，以防有害因子的泄漏。
　　
　　4．個人防護原理：由于屏障的作用不可能是可靠，萬一操作中有所疏漏也是很危險的，所以要按要求做好個人防護。個人防護要適宜、科學。建議個人防護分三級。一級防護用于BSL-1和BSI．-2，二級防護用于BSI．-3，三級防護用于BSL-4。
　　
　　二、安全*的原則
　　
　　安全是修造實驗室的直接目的，建造中一切不利安全的設計都應取締，一切與生物安全有沖突的參數設計都應服從安全的要求。例如：凈化要求要服從安全，使用方便服從安全，節約服從安全，人性化服從安全。
　　
　　三、軟件在先的原則
　　
　　修造實驗室前做好對擬從事的病原微生物和研究內容的危險評估，一定要有科學、合理的總體構思和概念設計。在此基礎上要根據操作過程的梗概進行平面布局工藝設計，然后再進行空調通風和電控等的具體設計。
　　
　　四、管理嚴格的原則
　　
　　一定要按照國務院發布的《病原微生物實驗室生物安全管理條例》進行管理。這個條例對致病微生物的管理原則是：病原微生物是分類管理，實驗室是分級管理。
　　
　　五、遠離病原的原則
　　
　　修建實驗室是為了研究致病微生物和高致病微生物，必要的實驗必須在實驗室內進行。但是，非必要的時候盡可能少接觸病原體或少進實驗室。例如，能在半污染區做的不進污染區；能在清潔區做的不進半污染區；進實驗室2人能完成不用3人；無關人員不進實驗室。使用實驗室后應及時凈化處理和滅菌，不要存留污物。不用的需要保存的菌（毒）液應送到保藏機構保存。
　　
　　六、預防為zii的原則
　　
　　從事病原微生物實驗活動，對實驗室感染應采取預防為主的原則，要把握三個環節，即：
　　
　　1．實驗室要使用經過生物和物理的檢測并且合格的安全柜、排風過濾器和高壓蒸汽滅菌器，確保達到零泄漏。