摘要:本研究聚焦噬菌體納米抗體展示庫電轉化效率提升難題。通過系統(tǒng)調(diào)控電轉化關鍵參數(shù),如電壓、電容、脈沖時長及感受態(tài)細胞狀態(tài)等,經(jīng)多輪對比實驗,成功優(yōu)化條件,顯著提高轉化效率,為高質(zhì)量納米抗體庫構建及篩選奠定堅實基礎,拓展其在生物醫(yī)學領域應用潛能。
噬菌體展示技術作為新興的強大生物技術平臺,在抗體工程領域占據(jù)關鍵地位,尤其是納米抗體的篩選與開發(fā),依賴高效的噬菌體展示庫構建。電轉化作為將外源 DNA 高效導入感受態(tài)細胞的關鍵步驟,其效率直接關乎噬菌體展示庫的質(zhì)量與多樣性。然而,當前常規(guī)電轉化條件在噬菌體納米抗體展示庫構建時存在轉化效率不穩(wěn)定、細胞損傷大等諸多局限,嚴重制約后續(xù)功能抗體篩選及相關應用拓展,亟待精準優(yōu)化以突破瓶頸。
菌株:選用大腸桿菌 TG1 菌株,其具備高效攝取外源 DNA 能力且利于噬菌體增殖,確保實驗基礎可靠性,購自專業(yè)菌種保藏中心,復蘇后經(jīng)嚴格平板劃線純化,-80°C 甘油保存?zhèn)溆谩?/p>
載體:采用特定噬菌體載體,經(jīng)基因工程改造,含有納米抗體基因片段插入位點及篩選標記,由實驗室前期構建并測序驗證準確性,提取純化后 -20°C 儲存,濃度與純度滿足實驗要求。
試劑:優(yōu)質(zhì)電轉感受態(tài)細胞制備試劑盒,確保制備細胞高效感受態(tài);各類限制性內(nèi)切酶、連接酶等分子生物學工具酶,均為高活性產(chǎn)品;電轉化緩沖液自行精確配制,含適量蔗糖、鎂離子等關鍵成分,調(diào)節(jié)滲透壓與離子強度。
電壓梯度設置:以常規(guī)電轉化儀為平臺,設置 1.0 kV、1.25 kV、1.5 kV、1.75 kV、2.0 kV 五組不同電壓,每組至少 3 個平行樣本,固定電容 25 μF、脈沖時長 5 ms,探究電壓對轉化效率及細胞存活率影響,記錄轉化后菌落數(shù)及細胞生長曲線。
電容調(diào)節(jié):選定最佳電壓后,將電容設為 15 μF、20 μF、25 μF、30 μF、35 μF,維持電壓與脈沖時長不變,重復轉化操作,分析電容變化下電穿孔效果差異,通過流式細胞術檢測細胞穿孔率輔助評估。
脈沖時長優(yōu)化:在優(yōu)化電壓、電容基礎上,對脈沖時長從 3 ms 至 7 ms 以 1 ms 間隔細分測試,深入剖析短暫強脈沖與稍長弱脈沖對 DNA 攝入及細胞完整性不同作用機制,結合顯微鏡觀察細胞形態(tài)完整性。
培養(yǎng)溫度精細調(diào)控:對比 30°C、32°C、34°C、36°C、37°C 培養(yǎng)大腸桿菌至對數(shù)生長期收獲制備感受態(tài),考察不同溫度下細胞膜流動性、蛋白表達差異對轉化接納能力影響,測定細胞膜脂肪酸飽和度等指標。
預處理添加劑篩選:向感受態(tài)制備體系分別添加 0.5% DMSO、1% 甘油、0.2 M 甜菜堿等化學試劑,探究其對細胞膜通透性、細胞抗電擊能力提升作用,利用熒光探針監(jiān)測細胞膜電位變化驗證添加劑效果。
復蘇培養(yǎng)基改良:設計含不同濃度葡萄糖、氨基酸組合復蘇培養(yǎng)基,旨在快速補充細胞能量、修復損傷,對比標準 LB 培養(yǎng)基,監(jiān)測轉化細胞起始生長速率及延滯期時長。
復蘇時間精準確定:設定 30 min、60 min、90 min、120 min、150 min 不同復蘇時長,考察細胞從電沖擊損傷恢復及外源 DNA 穩(wěn)定表達所需最短且高效時段,通過實時定量 PCR 檢測噬菌體基因轉錄起始時間。
隨電壓升高,轉化效率呈先升后降趨勢,1.5 kV 時菌落數(shù)達峰值,較 1.0 kV 提升約 3 倍;但高于 1.75 kV 后,細胞存活率急劇下降,顯微鏡下可見大量破碎細胞,表明過高電壓雖增強 DNA 驅(qū)動力卻嚴重破壞細胞膜,權衡效率與細胞存活,1.5 kV 為初步優(yōu)選電壓,后續(xù)實驗以此為基拓展優(yōu)化。
電容從 15 μF 增至 25 μF,轉化效率穩(wěn)步上升,25 μF 時達平臺期,繼續(xù)增大電容無顯著提升,反因電場能量過度積累微增細胞損傷,結合穿孔率數(shù)據(jù),確認 25 μF 為適配電容,與選定電壓協(xié)同構建適宜電穿孔電場強度與時長組合,保障 DNA 足量進入細胞且維持細胞活性。
4 ms 脈沖時長轉化效率優(yōu),短于此時長 DNA 進入不充分,長于則加劇細胞應激損傷,細胞膜完整性受損嚴重,特定基因表達失調(diào),該時長平衡電脈沖刺激與細胞耐受,使外源 DNA 精準、高效整合入細胞基因組,為后續(xù)噬菌體復制與展示奠定基礎。
34°C 培養(yǎng)制備感受態(tài)細胞轉化表現(xiàn)優(yōu)良,細胞膜流動性適中,關鍵轉運蛋白豐度高,利于 DNA 結合與內(nèi)化;1% 甘油添加組細胞膜穩(wěn)定性增強,電擊后維持較好完整性,減少內(nèi)容物泄漏,兩者協(xié)同預處理使轉化效率較原始條件提升近 5 倍,極大擴充可轉化細胞基數(shù)。
含 0.2% 葡萄糖與適量脯氨酸、纈氨酸的復蘇培養(yǎng)基顯著縮短細胞延滯期,加速修復損傷恢復生長;90 min 復蘇時長足以完成細胞膜修復、DNA 轉錄起始及噬菌體組裝關鍵進程,過早終止復蘇致轉化不穩(wěn)定,過長則營養(yǎng)耗盡抑制生長,優(yōu)化后整體轉化效率提升約 60%,保障高活性噬菌體展示庫產(chǎn)出。
本研究經(jīng)全方面、精細化電轉化條件探索,確定 1.5 kV 電壓、25 μF 電容、4 ms 脈沖時長組合,配合 34°C 培養(yǎng)及甘油預處理感受態(tài)細胞,采用特制復蘇培養(yǎng)基與 90 min 時長,構建全新高效電轉化流程。該優(yōu)化體系大幅提升噬菌體納米抗體展示庫轉化效率,降低細胞損傷,增強庫多樣性與功能性,為納米抗體研發(fā)提供更優(yōu)質(zhì)資源庫,助力精準靶向治療、生物傳感等前沿應用突破技術屏障,開拓廣闊前景,后續(xù)將聚焦大規(guī)模驗證及跨體系適配性研究。