你知道如何去除重組蛋白的融合標簽嗎?來看看吧!
百歐博偉生物:由于基因工程技術的發(fā)展,人們可以自由地將各種基因進行隨意的進行組合,表達出多種功能的蛋白質。蛋白融合標簽技術作為 DNA 重組技術的代表,通過在基因水平上改造目標蛋白,產生含有融合標簽的重組蛋白,兼具了原有蛋白質的功能活性和融合標簽所的生理生化特性。隨著蛋白藥物的飛速發(fā)展,融合標簽技術被廣泛地應用于科研及醫(yī)藥工業(yè)領域,尤其在蛋白質分離純化、膜蛋白結構研究、蛋白質生化功能研究等方面有著重要作用。
雖然融合標簽具有十分多的優(yōu)點,可以使蛋白的純化更加的快捷方便、能夠促進目的蛋白的正確折疊和可溶表達、利于蛋白質的表達和定位等;但是有時對目標蛋白也會造成不利影響。其主要表現在:①融合標簽可能會影響目標蛋白的構象。例如蛋白連接GST標簽后,雖然蛋白質的可溶性增加了,但是蛋白質構象卻發(fā)生了很大的變化。因此,在研究蛋白質結構時,需要移除融合標簽,排除融合標簽對蛋白質結構的影響;②融合標簽可能會抑制和影響目標蛋白的活性。例如,對用于癌癥治療的單抗 CC49 單鏈 Fv 片段(scFv)的研究表明,當多聚組氨酸標簽與 scFv 的 C 端相連接時,會對 scFv 部分抗原結合位點進行覆蓋,從而降低 scFv 對抗原的結合能力。
在研究蛋白質或酶的性質或功能時,往往需要考慮融合標簽的對其是否有影響。對于藥用蛋白質,融合標簽可能會對目標蛋白的藥效產生不利影響,此外還會對人體健康存在潛在影響,因而很有必要將融合標簽進行去除。
移除融合標簽最長常用的方法可分為:化學法、外切蛋白酶法、內切蛋白酶法和基于內含肽的自我剪切法。
一、化學法
化學方法移除多肽標簽所采取的基本策略為:在目標蛋白與融合標簽之間插入一個甲硫氨酸殘基,蛋白被誘導表達和純化后,用溴化氰或羥胺處理該融合蛋白,使目標蛋白與融合標簽在插入的甲氨酸殘基處斷裂,從而使標簽和目標蛋白分開。
溴化氰(CNBr)解法是多種化學法中最重要的也是見的方法。由Gross和witkop于1962年建立的,后人進行了系統研究,能專一裂解甲硫氨酸殘基的羧基端,產率達到85%。由于蛋白質中的甲硫氨酸含量一般都比較少,因此裂解后的肽段較少,新生成的肽段往往是大肽段。
化學法的優(yōu)點:化學法具有效率高、耗時短、成本低等。缺點:所需的反應條件容易破壞目標蛋白的結構和功能,而且所使用的溴化氰等試劑具有毒性,此法不適合于藥用蛋白;如果目標蛋白含有內源甲氨酸殘基,會發(fā)生非特異性斷裂,導致目標蛋白被破壞;此外,化學法切割時容易產生副反應,會對一些氨基酸側鏈進行修飾從而改變目標蛋白本來的性質。
二、外切蛋白酶法
外切蛋白酶能夠從蛋白質的 N 端或 C 端開始,依次切除一個或幾個氨基酸殘基,直到遇到某種特定的氨基酸殘基才會停止切割。外切蛋白酶的種類包括氨基肽酶和羧基肽酶,分別可以切除蛋白的 N 端和 C 端的融合標簽,例如氨基肽酶M (APM)和羧肽酶 A和B(CPA和CPB)等。
對于外切蛋白酶法切除融合標簽應用中,代表性的是基于二肽氨基肽酶(DPPI,商品名為DAPase)的作用機理所提供的 TAGZyme 系統,用于去除 N 端的多聚組氨酸標簽。DAPase 能夠從蛋白質 N 端依次切除二肽,當蛋白的 N 端出現 Lys、Arg、Gln 殘基,或者在 N 端第2個或第3個氨基酸殘基是Pro時,切除反應終止,酶切完成。
外切蛋白酶的作用獨立于目標蛋白內部的序列,不會造成非特異性切割,幾乎可以適用于任何目標蛋白。外切蛋白酶完成酶切的時間相對較短,也降低了造成目標蛋白變性失活可能性。外切蛋白酶完成酶切所需酶量也少于內切蛋白酶的用量,不但減少了非特異性切割的風險,還降低了后續(xù)去除該酶的難度。
三、內切蛋白酶法
內切蛋白酶能夠識別蛋白質的特定氨基酸序列,并從該序列內部或附近的特定氨基酸殘基處進行切割。使用內切蛋白酶時的一般策略:①選擇合適的內切蛋白酶,注意目標蛋白內部有多余的酶切位點;②構建表達載體時,在融合標簽與目的蛋白之間引入內切蛋白酶識別序列;③構建質粒、導入宿主并誘導表達、分離純化重組融合蛋白;④內切蛋白酶對融合蛋白進行酶切;⑤再次純化,去除內切蛋白酶和融合標簽。
在利用內切蛋白酶去除融合標簽時,內切蛋白酶的特異性和酶切效率主要受 3 種因素影響:①內切蛋白酶固有的非特異性酶切。如 Factor Xa 和凝血酶通常具有第二切割位點,并且第二位點的切割效率會隨著反應條件的不同而變化。非特異性切割可以通過優(yōu)化反應條件減少,但不能消除 ,因此在優(yōu)化條件時,需要檢測切割后的產物,以確定目標蛋白產物的均一性;②目標蛋白的結構。當融合蛋白的酶切識別位點位于蛋白質三維結構的內部時,內切蛋白酶活性中心難以識別到該位點,致使酶切效率變低。如在使用腸激酶對處于聚集狀態(tài)的目標蛋白所含的多聚組氨酸標簽的切除時,只有使目標蛋白的腸激酶的切割識別位點暴露出來后,才能獲得較高的酶切效率。③溶液中化學成分對酶切活性會產生影響,如去垢劑。在純化跨膜蛋白時,通常需要加入去垢劑,可能會影響內切蛋白酶的酶切效率。
在利用內切蛋白酶切除融合標簽之后,通常需要將內切蛋白酶除去掉。因此在內切蛋白酶時,盡量選取含有親和標簽的內切蛋白酶,在酶切完成后,通過二次過柱使帶親和標簽的內切蛋白酶吸附在柱上,而目標蛋白則洗脫下來。
四、基于內含肽的自我剪切法
內含肽(intein)是前體蛋白中的一段插入序列,能夠自我催化蛋白質的剪接(protein splicing),使自身從前體蛋白中切除,并將兩側的外顯肽(extein)連接形成成熟的蛋白。
相比于化學法,自我剪切法條件溫和,不會導致目的蛋白的變性。相對傳統的酶切法需要多次過柱純化(不僅需要分離融合蛋白還需除去蛋白酶及融合標簽),自我剪切法簡化了純化過程,節(jié)約了成本和時間。 此外,自我剪切法具有良好的特異性,一般只在剪接位點的氨基酸殘基上發(fā)生切割,避免了酶切法由于第二識別位點因素的存在發(fā)生的非特異性切割。但是自我剪切法在誘導剪切時需加巰基試劑,會影響目標蛋白的二硫鍵。
以上4 種方法各有利弊,需要綜合考慮目標蛋白的特性,以及標簽移除方法和實驗目的,選擇合適的方法。
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