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核酸電泳技術是生物化學中廣泛的一種技術，是指使用電流來操縱蛋白質分子以用于一系列生物醫學研究、診斷和制造目的實驗的過程。
目前核酸電泳技術分為以下4種：凝膠電泳、醋酸纖維素薄膜電泳、等電聚焦電泳、毛細管電泳。
1.凝膠電泳
凝膠電泳是常用的一種蛋白表達分析技術。
技術原理是根據檢體中蛋白質分子量大小的不同，使其在電泳膠中分離。在大腸桿菌表達純化外源蛋白的實驗中，SDS-PAGE更是較常用的操作。
技術應用是檢測蛋白的表達情況（表達量，表達分布），以及分析目的蛋白的純度等。聚丙烯酰胺凝膠電泳（PAGE）用于分離蛋白質較小分子核酸。瓊脂糖凝膠電泳適用于分離同工酶及其亞型、大分子核酸等。
2.醋酸纖維素薄膜電泳
醋酸纖維薄膜電泳操作簡單、快速、廉價。
技術原理以醋酸纖維薄膜為支持物，由纖維素的羥基經乙酰化而制成。這種薄膜對蛋白質吸附小，能消除電泳中出現的“托尾”現象，具有分離速度快、樣品用量小的特點，適合于病理情況下微量異常蛋白的檢測。
技術應用于血清蛋白、血紅蛋白、球蛋白、脂蛋白、糖蛋白、甲胎蛋白、類固醇激素及同工酶等的分離分析中，盡管它的分辨力比聚丙酰胺凝膠電泳低，但它具有簡單、快速等優點。
3.等電聚焦電泳
等電聚焦電泳是在電場中分離蛋白質技術的一個重要發展。
技術原理是在穩定的pH梯度中按等電點的不同來分離兩性大分子。
技術應用于分離分子量相近而等電點不同的蛋白質組分，在區帶電泳中分辨率最好。常用的pH梯度支持介質有聚丙烯酰胺凝膠、瓊脂糖凝膠、葡聚糖凝膠等。
4.毛細管電泳
毛細管電泳又稱高效毛細管電泳。
技術原理是以毛細管為分離通道、以高壓直流電場為驅動力的將液相分離，是一種利用電泳和電滲流的電動力學原理，在一種空芯的微小內徑的毛細管中進行混合物的高效分離技術。
毛細管電泳分類為：毛細管自由溶液區帶電泳、毛細管凝膠電泳、毛細管等電聚焦電泳及膠束毛細管電動力學色譜。
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