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生物顯微鏡廣泛用于生物學、細胞學、組織學、藥物化學等研究所工作，在醫學上可進行三大常規檢查，在學校實驗室可供教學之用。雙目生物顯微鏡采用電光源，照明可連續調節亮度，目鏡筒可360度自由轉動。
操作流程
1.取下顯微鏡的防塵罩，接通電源，開啟電源開關，根據玻片性質調整內置照明燈光亮度及光圈大小，使視野亮度處于合適范圍。
2.將事先準備好的玻片放到載物臺上，用標本片夾持器夾好，轉動移動手輪使等觀察樣品大致位于物鏡正下方。
3.拉開顯微鏡的電子眼，并打開電腦上的工作站，將屏幕調整到合適大小移到中間。
4.先用低倍物鏡（4倍）觀察樣品，轉動粗準焦螺旋和移動手輪，把樣品移到視野中間并調至清晰。
5.轉動轉換器，使高倍物鏡（10倍）對準樣品，調節細準焦螺旋，使視野清晰;如果樣品稍有偏離視野中央則調節移動手輪把樣品調到中央。
6.再次轉動轉換器，使高倍物鏡（40倍）對準樣品進行觀察，方法同10倍物鏡操作方法;此時視野亮度可能會變暗，應當調節內置照明燈光亮度及光圈大小使視野亮度處于合適范圍。
7.觀察完樣品后,取下載玻片,先將聚光器降下﹐再將物鏡轉成“八”字形，轉動粗調節器使鏡筒下降，以免接物鏡與聚光器相碰，并將鏡筒緩緩下降到低處，關掉電子眼及工作站，關閉電源，罩上防塵罩，將顯微鏡歸位。
日常維護
1.顯微鏡要放在干燥的地方，不能在陽光下暴曬和使用。
2.不要隨意取下目鏡，以防止塵土落入物鏡，也不要任意拆卸各種零件，以防損壞。
3.顯微鏡要輕拿輕放，放到試驗臺上時，先放鏡座的一端，再將鏡座全部放穩，切不可使鏡座全面同時與臺面接觸，這樣震動過大，透鏡和微調節器的裝置易損壞。
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